Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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