Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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