Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Bcl11bQ99PV8 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Bcl11bQ99PV8 Olfr1329-201ENSMUST00000071979 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Bcl11bQ99PV8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Bcl11bQ99PV8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Bcl11bQ99PV8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Bcl11bQ99PV8 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Bcl11bQ99PV8 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Bcl11bQ99PV8 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Bcl11bQ99PV8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bcl11bQ99PV8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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