Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms