Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rab28Q99KL7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rab28Q99KL7 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rab28Q99KL7 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rab28Q99KL7 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rab28Q99KL7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rab28Q99KL7 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rab28Q99KL7 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rab28Q99KL7 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rab28Q99KL7 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rab28Q99KL7 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms