Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Pacsin3Q99JB8 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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