Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Depp1Q8K2F3 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms