Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Ercc8Q8CFD5 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
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Ercc8Q8CFD5 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
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Ercc8Q8CFD5 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Ercc8Q8CFD5 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Ercc8Q8CFD5 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Ercc8Q8CFD5 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Ercc8Q8CFD5 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Ercc8Q8CFD5 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Ercc8Q8CFD5 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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Ercc8Q8CFD5 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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Ercc8Q8CFD5 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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