Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccser1Q8C0C4 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms