Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms