Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms