Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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