Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms