Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfaip3Q60769 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms