Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tdrd5Q5VCS6 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tdrd5Q5VCS6 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tdrd5Q5VCS6 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tdrd5Q5VCS6 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tdrd5Q5VCS6 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tdrd5Q5VCS6 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tdrd5Q5VCS6 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tdrd5Q5VCS6 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tdrd5Q5VCS6 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms