Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms