Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc5b-201ENSMUST00000029132 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm43693-201ENSMUST00000196072 1249 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms