Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms