Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms