Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Q3U6N9 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Q3U6N9 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Q3U6N9 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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