Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms