Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms