Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Snrp1c-ps1-201ENSMUST00000205464 474 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Cd74-203ENSMUST00000167610 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm13543-201ENSMUST00000121230 796 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm42467-201ENSMUST00000202954 1447 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm14676-201ENSMUST00000117722 858 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm44649-202ENSMUST00000206896 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm44664-201ENSMUST00000206841 1786 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Zdhhc9-201ENSMUST00000037960 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms