Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms