Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Otx1P80205 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Otx1P80205 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms