Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Gm15601-201ENSMUST00000122972 4033 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sem1P60897 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Fgd3-202ENSMUST00000110086 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Mfsd2b-204ENSMUST00000137337 2641 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Ccdc40-202ENSMUST00000053440 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm5114-201ENSMUST00000108017 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Cldn12-207ENSMUST00000179804 3752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Wdr6-201ENSMUST00000068700 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Plekho2-201ENSMUST00000068944 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Ptgds-201ENSMUST00000015234 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Bmf-201ENSMUST00000090219 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Pnpla1-202ENSMUST00000114737 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Pnpla1-201ENSMUST00000056866 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Kcnip4-204ENSMUST00000166924 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm35394-201ENSMUST00000196434 3252 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Ctns-202ENSMUST00000108476 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Limk2-204ENSMUST00000110029 2939 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gimap8-203ENSMUST00000203509 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Orai2-202ENSMUST00000196454 3990 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Pcdhb11-201ENSMUST00000053073 4419 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Scml2-202ENSMUST00000074802 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 6030443J06Rik-203ENSMUST00000181764 4299 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Stk38l-202ENSMUST00000111644 2274 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Limk2-202ENSMUST00000101640 3711 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Apol11b-201ENSMUST00000166623 2057 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Nnt-206ENSMUST00000223268 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm1559-201ENSMUST00000219596 3117 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Rtp1-201ENSMUST00000038730 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 4933416O17Rik-201ENSMUST00000220972 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Snx25-201ENSMUST00000041582 3206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms