Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms