Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms