Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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