Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lmo2P25801 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lmo2P25801 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lmo2P25801 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lmo2P25801 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Lmo2P25801 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lmo2P25801 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo2P25801 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms