Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms