Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms