Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18533 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18533 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18533 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P18533 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18533 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18533 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18533 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P18533 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18533 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18533 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18533 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms