Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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P18528 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
P18528 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
P18528 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
P18528 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
P18528 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
P18528 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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P18528 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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P18528 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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P18528 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
P18528 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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P18528 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
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P18528 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
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P18528 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
P18528 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
P18528 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
P18528 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
P18528 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
P18528 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
P18528 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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