Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms