Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P10404 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P10404 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms