Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Tnfrsf22-204ENSMUST00000171066 1780 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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