Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ifna9P09235 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms