Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms