Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P01641 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P01641 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P01641 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P01641 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P01641 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P01641 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P01641 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P01641 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P01641 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
P01641 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P01641 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P01641 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
P01641 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P01641 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P01641 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01641 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms