Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms