Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rnf13O54965 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rnf13O54965 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rnf13O54965 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rnf13O54965 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rnf13O54965 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rnf13O54965 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rnf13O54965 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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