Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
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Cldn34c3J3QJW5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Cldn34c3J3QJW5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Cldn34c3J3QJW5 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Cldn34c3J3QJW5 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Cldn34c3J3QJW5 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Cldn34c3J3QJW5 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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Cldn34c3J3QJW5 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
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