Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 449.5 ms