Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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