Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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