Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Skint4A7TZF3 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms