Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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