Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Lcn6A2AJB9 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Lcn6A2AJB9 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Lcn6A2AJB9 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Lcn6A2AJB9 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Lcn6A2AJB9 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Lcn6A2AJB9 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Lcn6A2AJB9 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Lcn6A2AJB9 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lcn6A2AJB9 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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