Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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